Институт за низијско шумарство и животну средину поседује следеће лабораторије:
- Лабораторија за испитивање квалитета семена
- Лабораторија за ентомологију
- Лабораторија за фитопатологију
- Лабораторија за испитивање земљишта
- Лабораторија за микропропагацију
- Лабораторија за молекуларна истраживања
- Лабораторија за дендрохронологију и анатомију дрвета
- Лабораторија за физиологију и биохемију